用R编写自己的Package | /cn/2007/09/writing-r-packages/

抱歉，S-Plus和R的garch我都不了解。但S-Plus的代码大多数都是可以在R下运行的，你可以看看S+的函数是否可以查看源代码。

——原帖发布于 2010-03-17 07:52:31

所有的函数源代码都放在包的目录R下，编译的时候这个文件夹下的所有R代码中的所有函数和对象都会被编到包中。你在CRAN上随便找个源代码包下载下来看看就知道了。

——原帖发布于 2011-02-27 01:15:26

访客 *miriam* @ 2011-02-27 08:32:45 写道：

谢谢！我还想问问 我在网上看到一个例子说：假如有一个函数 那么在man文件夹下会产生两个文件。如一个limnod.rd文件和一个limnod-package.rd，这两个文件有什么区别呀？我只产生了一个-package.rd文件，是不是要手动添加.rd文件呢？ 如果自己又添加了很多函数 那么在man文件夹里添加关于这些函数的说明文件是.rd文件还是-package.rd文件呢？ 谢谢您啊！ 我可能问的问题有点低级……呵呵

linmod.rd是函数linmod()的帮助文档，linmod-package.rd是这个包的帮助文档（包的名字叫linmod）。这个例子不太好，容易引起混淆。通常来说，函数的帮助文档是必须的，包的文档是可选的，但这个文档如果好好写，对读者来说也是个好的导航。每个函数都要有一个相应的帮助文档。

如果你真要写包，我还是推荐用Emacs+roxygen，它比官方的做法起码快十倍。写rd文件太麻烦了。但roxygen和Emacs又不是一两句话能说清的东西……

——原帖发布于 2011-02-27 09:53:58

访客 *miriam* @ 2011-02-28 06:19:00 写道：

非常非常感谢您的帮助！

额滴神啊，但愿你不是从我这里学的如何写R包，你说的这些工具中，Perl和htmlhelp都不必装了，只要装R本身和Rtools就够了（当然，最好还有LaTeX）。

code_files参数要提供的是源代码的路径，如果你提供的路径不带文件夹，你的意思就是说这个（些）代码文件在当前目录下。既然报错说找不到，那么肯定不在当前工作目录下（看getwd()）。

如果你是新手，我建议的方式是把你的代码在R里面运行一遍，然后package.skeleton('包名', list = c('这个函数名', '那个函数名等等'))

——原帖发布于 2011-03-10 09:11:26

访客 *guanyuan* @ 2011-03-10 10:36:17 写道：

非常感谢您的回答。
呵呵，我的确是个新手,不是从您这里学的写包。
我明白你的意思了，原来hello.r不是系统自带的啊，我只是安装了环境，然后就调用命令了，这是不对的。

还有一个问题，想请教您。
先描述一下问题吧：
我自己复制了一段代码存为freq.r。但在build的时候出错了，出现了如下的提示：
##########################################################
D:Program FilesRpackage>R CMD build freq

• checking for file 'freq/DESCRIPTION' ... OK
• preparing 'freq':
• checking DESCRIPTION meta-information ... ERROR
  畸形维修人员域.

请参考'如何写R附加软件'说明书'写R程辑包'这一段中关于DESCRIPTION文件的信息.
#####################################################################

我具体的操作过程是下面这样的。

现在我复制了一段代码（这段代码我还看不懂）
freq <-
function(matr)
{
matr <- as.matrix(matr)
if(is.matrix(matr)){
stop("The input data must be matrix!n")
}
if(any(is.na(matr))){
matr 1] <- 1
result <- apply(matr, 2, sum)/nrow(matr)
return(result)

}

将它保存在D:Program FilesRpackage下面的freq.r
然后，我启动RGui，设置工作目录
setwd("D:/Program Files/R/package")
载入freq.r到内存
source("freq.r")
然后，打包
package.skeleton( name="freq", list= ls() )

以上步骤都成功通过的。
并且生成了新的文件夹freq。

然后，我又按照教材，读过并删除了read-and-delete me文件。
接下来，修改了description文件。

Maintainer一栏中没有写名字，只有邮箱。请参照Writing R Extensions画瓢。

——原帖发布于 2011-03-11 07:19:29

我生物方面了解一丁点，统计方面水平很低。

——原帖发布于 2011-03-15 07:39:58

访客 *guanyuan* @ 2011-03-15 07:41:21 写道：

不好意思，谢谢啦。

简单回答：remove.packages()；复杂回答：因为它有很多依赖的包，所以不知道你装的过程中究竟装了多少依赖包，理论上这些都可以删掉，但得手工检查。装R包的时候最好不要装在和R同一个目录下，装在用户目录下比较好。这又不是三两句话能讲清的东西了。

——原帖发布于 2011-03-15 07:42:30

访客 *guanyuan* @ 2011-03-15 07:46:56 写道：

谢谢，您回答得已经很好了。

我给了一个最简化的例子：
https://github.com/yihui/r-ninja/tree/master/examples

——原帖发布于 2012-03-19 06:50:17