编写R程序包的基本步骤和注意事项[简略版] | /cn/2007/11/steps-to-write-r-packages/

访客 *colinisstudent* @ 2007-11-06 09:09:03 写道：

已经是编包的人了。。。。我们都还处于下包的阶段

访客 *hUhUhU* @ 2007-11-09 14:43:13 写道：

厉害厉害，发包一族。

@Jiangtang

访客 *chendana* @ 2010-05-10 12:07:37 写道：

假如现在我已经有了一个编好的R函数，用来给出回归的精确结果,存成了r脚本的格式,文件名为linmod.r

linmod<- function(x, y)

{

compute QR-decomposition of x

qx <- qr(x)

compute (x'x)^(-1) x'y

coef <- solve.qr(qx, y)

degrees of freedom and standard deviation of residuals

df <- nrow(x)-ncol(x)

sigma2 <- sum((y - x%*%coef)^2)/df

compute sigma^2 * (x'x)^-1

vcov <- sigma2 * chol2inv(qx$qr)

colnames(vcov) <- rownames(vcov) <- colnames(x)

list(coefficients = coef,

vcov = vcov,

sigma = sqrt(sigma2),

df = df)

}

(1)清除内存中的对象：

rm(list=ls())

(2)设定工作目录，这里设定为 c:/pa

setwd("c:/pa")

(3)将制作包的源文件 linmod.r拷贝到c:/pa/文件夹下,

之后输入：

package.skeleton(name="linmod",code_files="c:/pa/linmod.r")

症状如下: 运行package.skeleton()时出现如下提示.

Error in sprintf(gettext(fmt, domain = domain), ...) :

Error in sprintf(gettext(fmt, domain = domain), ...) :

但是,其它的文件夹如:R,data都是正常的.
有谁能指点一下是什么原因吗?
我用的版本是2.11.0，谢谢前辈指点

访客 *Nan Xiao* @ 2010-11-03 23:48:26 写道：

你要做的工作只是：写函数的源程序（.r）和帮助文档（.Rd）

R-exts里似乎提到过, 扩展名最好写大写的".R", 因为小写的".r"有其他软件也用到. 这样才完美.

@nanxstats

访客 *guanyuan* @ 2011-03-11 07:09:03 写道：

你好，我最近使用R语言软件，有几个困惑的地方，不知您是否可以帮忙解决下。
先谢谢您了。

（1）搭建好包框架后，先build 还是先 check
（2）windows下build时用命令 R CMD build --binary pkgname
怎么有的地方说是这样 Rcmd build --binary pkgname
我搞不明白了。
（3）为什么在windows下要加载.zip文件？能解释下.zip文件对于windows有什么意义吗？
（4）既然网上有那么多的可用包，为什么我们还要自己写包呢？因为教程里面都有讲这方面的东西，但是我觉得用不到吧？
（5）帮助文档中“#”是起注释作用的，但是还有些符号，如波浪线“～～”是什么意思呢？我觉得仍然是注释作用？
（6）建立好包框架后，生成帮助文档，哪些是必须修改的，不修改会导致build和check通不过吗？我不了解修改这些内容有什么意义，是给别人看的吗？
（7）我使用check命令会出现错误

• checking whether package 'freq' can be installed ... ERROR
  不晓得原因出在哪里呢？
  （8）我使用build命令，会出现很多cygwin warning:不知道是什么原因。

访客 *guanyuan* @ 2011-03-11 07:13:05 写道：

还有一个问题：
为什么build和check的时候，必须在命令行模式下进行，不能在R语言界面下进行吗？

访客 *guanyuan* @ 2011-03-11 07:15:44 写道：

还有2个问题：
（1）为什么build和check的时候，必须在命令行模式下进行，不能在R语言界面下进行吗？
（2）有些书中说，要安装Rcmdr，有必要吗？安装Rcmdr之前要先安装car，于是乎，我照办了，在安装过程中，还出现说一些东西missing，是否镜像安装，我选了是，然后一个持续时间很长的下载安装过程开始了。。。现在仍在继续呢，我要终止吗？

访客 *guanyuan* @ 2011-03-11 13:00:53 写道：

等我把一些问题都搞懂之后，我会听从您的建议，把帖子发到cos论坛。
呵呵，还有几个问题想要在您这里明确一下。
（1）编号一个.r函数文件，然后加载到内存，搭建包框架，会生成一个同名目录，里面的帮助文档不修改，不会引起后续的build和check出错吧？也就是说，错误应该在函数本身?
（2）我最近才接触R语言，不知道R软件包 扮演着什么角色。您能跟我说说吗？
（3）安装了R软件包之后，如何使用它呢？是找它里面的.r文件，看看是什么名字，然后在RGui中输入函数名，是这样子吗？
（4）我之所以接触R语言，好像老师跟我说要处理一些生物计算相关的东西，主要用到微阵列，但是老师说matlab中aoinformation这方面的功能更强大，学习R只是为了方便跟别人交流。您了解吗？
（5）我现在搞这个R搞了两天了，还没有成功建一个R包，不知道是什么原因，呵呵，是我运气不好吗？我真的不晓得什么原因。我怀疑是我最初拷贝的那个函数有问题，但是概率很小。

访客 *miriam* @ 2011-03-30 14:04:27 写道：

您好，我现在有一个问题是关于R CMD check的，我也出现了 checking whether package 'data' can be intalled... ERROR 的情况，具体的出错的信息如下：

• installing source package 'DBPvalue' ...
  Error in sprintf(gettext(fmt, domain = domain), ...) :
  ''='憼96>'>=', 空格, 或在括号内的适当版本数目.'多字节字符串有错
  ERROR: installing package DESCRIPTION failed for package 'DBPvalue'
• removing 'C:/DOCUME～1/ADMINI～1/MYDOCU～1/DBPVAL～1.RCH/DBPvalue'

我想问问 这可能是哪儿的错误呢？ 因为我找遍了可能的问题 都不知道这个问题是出现在哪里的？ 请问 我能不能通过某种方式 找到出错的 是在哪个文件 哪个部分吗？ 在dos下 用 R CMD help 会有很多选项 可是我不知道那些选项具体怎么用？麻烦您指点一下 非常感谢

2. 如果例子里用了dontrun{} 那么这个例子还要经过R的check吗？

3.如果一个distance.rda的数据 经过data（distance）以后，是不是就被读入，变成一个变量了呢？distance需要加引号吗？（如data（"distance"））

非常感谢您的帮助！！

访客 *miriam* @ 2011-03-30 14:31:08 写道：

我在 R CMD build 中也遇到了问题 *checking DESCRIPTION meta-information... ERROR
Depends/Suggests/Imports/Enhances这些域中有些是畸形的。
有问题的条目为：
R(>=2.12.0)
每条目都必须是程辑包的名字，名字后面可以跟'='， 空格，活在括号内的适当版本数目
（我在description里的depends是：Depends: R(>=2.10.0), methods, fdrtool）我觉得没有错啊。。。我不知道哪儿错了
再这前面有一句话是 *checking for file 'DBPvalue/DESCRIPTION'... OK 不明白它俩之间检查的有什么不同 ？谢谢您

访客 *fan* @ 2011-09-23 09:10:27 写道：

“本文已经过期”，负责的人啊……

@thinkfan

访客 *Wenxiao* @ 2014-07-01 22:49:48 写道：

佩服你